高幡不動尊金剛寺是土方家菩提寺。菩提寺是日本的寺廟類別，為家族代代歸依及埋葬祖先遺骨。雖然土方歲三的墓碑位於石田寺，但牌位卻被供奉在高幡不動尊金剛寺裡的大日堂。高幡不動尊金剛寺的奧殿內收藏新選組及幕末時期的一些文物，值得一看。
寺院的入口處設有土方歲三的銅像，及土方歲三與近藤勇的紀念碑文。而對面的點心店外牆更塗上土方歲三肖像，遠望高幡不動尊。
高幡不動尊 (Takahata-Fudoson Kongoji)
地址：日野市高幡733
參觀時間：奧殿、大日堂 09:00~16:00
參觀費用：奧殿為300日圓，大日堂為200日圓
交通：從土方歲三資料館至高幡不動尊，乘搭多摩都市單軌電車往「高幡不動車站」，步行約七分鐘
SHINSENGUMI 新選組 